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2018년 공학인의 밤

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Publish Date: (2024-05-17|3:35 pm), Modified Date: (2024-07-01|7:02 am)


--- Blog Post Contents
스마트 정션 박스(SJB, AKA 실내 휴즈 박스, 퓨즈 박스) 교체
여름 오기 전에 에어콘 청소한다고... 에어콘 필터 갈고, 에바 청소를 했는데... 에바 청소액이 흘러 넘쳐서... 퓨즈 박스(스마트 정션 박스, 부품번호 91950 3Z011)를 해먹었네요. 증상은 조수석 깜빡이가 안 되기 시작했습니다. 나중에는 헤드라이트도 안 들어오고... 결국은 시동도 안 꺼지고, 안 켜지고... 첫 증상이던 조수석 깜빡이 안 될 때, 바로 바데리 탈거하고... 에바 청소액에 젓은 부분 마르게 뒀어야 했는데... 계속 안 된다고... 시동 걸고, 헤드라이트 켜보고 하다가... 퓨즈 박스 해먹었네요. 퓨즈는 다 확인 했는데... 끊어진것 없었습니다. 시커멓게 타 버렸네요... 스마트 정션 박스가 데미지 먹은 듯... 단자 청소 스프레....... (Publish Date: 2024-05-30)

Closer address for driver swing
Gary Edwin 씨의 online swing advice 드라이버 다운 스윙시 찍혀 맞거나, 덮혀 맞아서... launch angle 이 너무 낮다고 하니... 드라이버 어드레스가 너무 멀다고... 더 가까이 서거라!!! 1.손의 위치 쯤에서 구부려라...(뭘요??? 아마도 왼팔???) 2-1. 좀 더 몸에 가까운 어드레스 2-2. 좀 더 몸에 가까운 어드레스 3-1. take back을 위해 출발!!! 3-2. take back을 위해 출발!!! 3-3. take back을 위해 출발!!! 셋을 잘 지나고... 4. 여기까지 오면 충분함 5. 임책트 후 모습! (Publish Date: 2023-02-21)

클럭스프링 교체 및 패들시프트 장착
작년 추운 겨울에 핸들(steering wheel)에 열선이 안 돼서... 아침마다 얼음장같은 핸들을 잡느라 너무 힘들었는데... 원인의 가능성 중에 하나가 클럭스프링이어서 교체해 봤습니다. 클럭스프링을 교체하려면, 핸들을 띄어야 해서... 핸들 띄면서 할 수 있는 다른 작업도 같이 했어요. 일단 알리발 가죽 핸들 덧데기??? 그리고, 패들쉬프트... 그러기 위한 부품 내용 입니다. 다른건 다 i40용 부품인데... 패들쉬프트 좌/우는 i40용이 아니라, yf소나타용으로 했습니다. 같은 가격인데... 다른 분들이 더 부드러운 작동감이 있다고 해서... 부품은 다 인터넷으로 구입했습니다. 동네 부품점도 있지만, 간혹 부품이 없을 수도 있다고 해서... 드....... (Publish Date: 2022-05-31)

i40 : 범퍼 분리 후 전방 센서 교체
준비물 : + (주먹)드라이버, 11m 복스, 얇은 - 드라이버 1. 범퍼 분리하기 11mm 육각 나사, +자 플라스틱 나사, +자 일반 나사 풀기 빨간 동그라미 : +자 플라스틱 나사. 노란 사각형 : 11mm 육각 나사 본넷 열고, 본넷에 보이는 플라스틱 나사랑 흡입구의 11mm 육각볼트를 분리합니다. 11mm 육각나사 푼 후, 흡입구를 위로 뽑아냅니다. 큰 힘이들어가지 않습니다. 빨간 동그라미 : +자 플라스틱 나사, 주황 동그라미 : +자 일반 나사 그리고, 아래쪽에는 휠하우스쪽에 일반나사, 그리고 휠하우스 아래 끝쪽과 전방 센서 중 측면 센서 아래쪽에 플라스틱 나사를 빼면 됩니다. 나사랑 육각볼트 뺐으면 휠하우스 쪽부터 살살 당겨서 범퍼를 분리합....... (Publish Date: 2022-05-23)

ms office에서 pdf 만들고 crop 하기
무료 pdf 파일 crop tool 입니다. 저는 스캔한 책을 개인 용도로 아이패드에서 보기 위해 사용하고 있는 tool 입니다. 1. ms office에서 pdf 파일 만들기 2. pdf crop tool 설치 https://sites.google.com/site/pdfscissors/ 2-1. 설치 전 java 가상 머신(jre) 설치 (java 개발자가 아니면 jdk가 아니라 jre로 충분) https://www.java.com/ko/ 2-2. crop tool 다운로드 및 설치 3. pdf crop tool 사용법 3-1. crop tool 더블 클릭!!! 3-2. 보안 경고 check 후 실행 클릭 3-3. pdf 파일 불러오기 All pages together 선택 참고로 책을 스캔한 경우 짝수/홀수 page pattern이 있다면 Odd and even pages separately 선택 3-5. crop 위치 지정 후 저....... (Publish Date: 2021-05-13)

test
(Publish Date: 2021-04-29)

biopython pairwise2 기반의 aligner
aligner에는 주로 ref seq와 PCR후에 ngs read를 비교할 때 사용합니다. 대표적으로 CRISPResso2, EMBOSS needle 등 이 있습니다. 그리고 biopython에서 지원하는 pairwise2와 aligner가 있습니다. 이 중에 pairwise2 기반으로 python이나 biopython이 깔려 있지 않은 환경에서도 사용할 수 있는 앱을 만들어 봤습니다. https://github.com/astroboi-SH-KWON/pairwise2_aligner_GUI 앱의 git 주소입니다. 다운로드하셔서 자유롭게 수정하셔도 됩니다. http://naver.me/50tQqL8D python이 안 깔려있어도 사용할 수 있는 exe 파일 링크입니다. 아래 댓글 남겨 주시면 link 비번 답글 드리겠습니다. 이렇게 icon 이미지도 넣어봤습니다. default 는....... (Publish Date: 2020-11-19)

대용량 파일 (100MB이상) git에 등록하기
# 대용량 파일 있는 곳에서 cmd 창 열고, upload할 파일 track 하기 git lfs track "*.csv" # 그 폴더에 .gitattributes 파일 생성 확인 후 .gitattributes 파일 add 하기 git add .\.gitattributes # 대상 upload 파일 add 하기 git add "*.csv" # commit 하기 git commit -m "{commit 노트}" # push 해주기 git push origin master # push 할 때 github 로그인 창이 뜹니다. 대용량 파일 업로드 완료~~ (Publish Date: 2020-11-06)

Arctic Code Vault Contributor가 되다...
https://archiveprogram.github.com/ 흠... 허접한 코드들을 후대에 남기게 생겼네... https://www.youtube.com/watch?v=fzI9FNjXQ0o&feature=emb_title (Publish Date: 2020-07-20)

영어 논문 001
1. 단어를 넓고 "깊게" 외우기 2. 연어(공기어) 공부 (collocation, 짝꿍 단어) 특정 단어와 같이 잘 나오는 단어들 ozdic.com 사전 사용 이음 동의어 -> 세로축 사용 3. 구동사 "phrasal verb list" 4. metaphor (Publish Date: 2020-07-10)

multiprocessing
from time import clock import time import os import multiprocessing as mp import numpy as np import Util import LogicPrep import Logic ############### start to set env ############### WORK_DIR = os.getcwd() + "/" NGS_read = "input/NGS_read_test.txt" # NGS_read = "input/NGS_read.txt" REF_SEQ = "input/Reference_test.txt" # REF_SEQ = "input/Reference.txt" PAIRWISE2_OPT = [] MULTI_CNT = 10 # MULTI_CNT = 36 TOP_N = 5 IDX = 0 ############### end setting env ################ def multi_processing(): uti....... (Publish Date: 2020-06-15)

genbank # 2 : file handling (.dat 파일)
from Bio import SeqIO from time import clock def read_genbank(): # 읽을 파일의 형식 선언 "genbank" for seq_record in SeqIO.parse(WORK_DIR + genbank_file_name, "genbank"): print("id : " + seq_record.id) # ['data_file_division', 'date', 'accessions', 'sequence_version', 'keywords', 'source', 'organism', 'taxonomy', 'comment'] print(seq_record.features) seq_feature = seq_record.features seq_f = seq_feature.__iter__() while True: try: gene = next(seq_f) # print(gen....... (Publish Date: 2020-06-12)

genbank # 1 : file format
1. genbank 파일 형식 biopython 이 다 분석해 줄거임~ (Publish Date: 2020-06-12)

FASTA # 2 : file handling
from Bio import SeqIO from time import clock file_path = "fasta 파일 위치" def read_FASTA(): # 읽을 파일의 형식 선언"fasta" for seq_record in SeqIO.parse(file_path, "fasta"): #seq_record에 하위 attribute들 id, name, description 등 print("id : " + seq_record.id) print("name : " + seq_record.name) print("description : " + seq_record.description) # fasta 파읽의 실제 sequence, String처럼 취급 가능 print(repr(seq_record.seq)) print(len(seq_record)) start_time = clock() print("start >>>>>>>>>>&gt....... (Publish Date: 2020-06-11)

FASTA # 1 : 종류
1. 일반적인 whole genome 의 FASTA 파일 2. CDS 정보만 있는 FASTA 파일 위의 full sequnce 와 달리 coding 부분만 발췌된 파일입니다. (Publish Date: 2020-06-11)

FASTQ 파일 읽기
import os from Bio import SeqIO import glob # current working directory 위치 반환 WORK_DIR = os.getcwd() + "/" # WORK_DIR 내의 모든 .fastq 파일의 full path 읽기 sources = glob.glob(WORK_DIR + '*.fastq') fastqdict = {} for i in range(len(sources)): # 읽을 파일이 "fastq" 형식의 파일인것 선언 temp = list(SeqIO.parse(sources[i], "fastq")) # 파일명 key, 파일내의 fastq sequence가 list 형태로 들어감 fastqdict[sources[i]] = [str(temp[k].seq) for k in range(len(temp))] """ :param FASTQ file : FASTQ 파일 분석 방법 링크(How t....... (Publish Date: 2020-06-11)

Biopython 시작
대용량의 FASTQ, FASTA 등등의 파일을 분석하기 위해 시작하였습니다. 아래는 앞으로 쓰게 될 대부분의 내용에 대한 출처들입니다. 출처는 차 후에 추가 될 수 있습니다. 출처 # 1 : https://biopython.org/ # biopython 설치 conda install -c anaconda biopython 출처 # 2 : https://www.biostars.org/ (Publish Date: 2020-06-11)

ios 에서 외장 스토리지 쓰기
드디어 애플 ios에서 외장 스토리지 지원을 했다는 소식에 라이트닝-otg usb 를 구입하여 여러 외장 스토리지 사용을 해보았습니다. 제가 구입한 알리발 라이트닝-otg usb 입니다. 다른 분들 글에 보면 usb 메모리, SD카드, micro SD 인식에 문제가 없는 것을 확인 하실 수 있습니다. 블로그에 올리진 않았으나 usb 메모리, SD카드 , microSD 카드등은 iPhone 11 pro, iPad pro 2 에서 잘 인식 되었습니다. 일부 글에 외장하드 인식 문제가 있어서 그 부분에 대해서만 추가로 글을 쓰고자 합니다. 외장 하드는 삼성 T3 SSD ugreen 외장하드 케이스(+ 집에 뒹구는 잘만 128GB SSD) ugreen 외장하드 케이스(+ 구형 노트북에서 적출한 segate 500 GB....... (Publish Date: 2020-01-23)

2018년 특수대학원 연합 체육대회
2018년 특수대학원 연합 체육대회 (Publish Date: 2019-10-02)

2018년 공학인의 밤
2018년 고려대학교 공학대학원 공학인의 밤 일시 : 2018. 11. 28 수요일 19:00~21:30 장소 : 멜레니엄 서울 힐튼 호텔 그랜드 볼룸 (Publish Date: 2019-10-02)

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